Одной из причин может быть биологический датчик случайных чисел. В случае работы с КриптоПро CSP нажмите на вкладке «Оборудование» кнопку «Настроить ДСЧ» и добавьте биологический датчик случайных чисел.
В случае работы с ViPNet CSP биологический датчик нужно выбрать в качестве используемого в разделе «Датчик случайных чисел».